Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DKK3Q9UBP4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DKK3Q9UBP4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms