Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP2BPQ9P2M1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP2BPQ9P2M1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms