Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms