Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEP44Q9C0F1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms