Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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