Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms