Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAAF1Q9BRP4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms