Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FYCO1Q9BQS8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms