Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms