Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms