Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMARCD3Q6STE5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMARCD3Q6STE5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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