Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RTL6Q6ICC9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RTL6Q6ICC9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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