Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRRT3Q5FWE3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms