Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LTC4SQ16873 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms