Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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