Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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RTN1Q16799 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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RTN1Q16799 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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RTN1Q16799 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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