Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FSCN1Q16658 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms