Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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RPE65Q16518 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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