Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SS18Q15532 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SS18Q15532 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SS18Q15532 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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