Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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RFTN1Q14699 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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RFTN1Q14699 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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RFTN1Q14699 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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RFTN1Q14699 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN1Q14699 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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RFTN1Q14699 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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RFTN1Q14699 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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RFTN1Q14699 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFTN1Q14699 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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