Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOFQ13790 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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