Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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