Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FAM27E3Q08E93 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms