Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POU5F1Q01860 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms