Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms