Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms