Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms