Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM193AP78312 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms