Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HBBP68871 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms