Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RPS29P62273 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms