Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZEB1P37275 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZEB1P37275 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms