Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms