Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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