Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms