Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD58P19256 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CD58P19256 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD58P19256 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD58P19256 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD58P19256 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD58P19256 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD58P19256 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD58P19256 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD58P19256 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD58P19256 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD58P19256 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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