Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTPS1P17812 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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