Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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HOXD4P09016 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXD4P09016 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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