Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms