Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCATO75600 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCATO75600 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCATO75600 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms