Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms