Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms