Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB5A4FU69 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms