Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms