Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REXO2Q9Y3B8 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REXO2Q9Y3B8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms