Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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HOXC10Q9NYD6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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HOXC10Q9NYD6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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HOXC10Q9NYD6 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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HOXC10Q9NYD6 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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HOXC10Q9NYD6 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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