Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms