Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZCCHC17Q9NP64 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms