Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF6Q9BYE7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF6Q9BYE7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms