Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms