Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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C9orf16Q9BUW7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf16Q9BUW7 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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